Národné kompetenčné centra pre HPC zo Slovenska a Poľska organizujú dvojdňový workshop zameraný na softvérový kvantovo-chemický balík ORCA. ORCA ponúka špičkovú funkcionalitu v obastiach aplikácie teórie funkcionálu hustoty (density functional theory) ako aj metód založených na (korelovanej) vlnovej funkcii. Programový balík ORCA teda je zaujímavou alternatívou iných, aj komerčných, kvantovo-chemických programových balíkov. Účastníci kurzu sa naučia základy práce s balíkom ORCA a prostredníctvom “hands-on” cvičení získajú zručnosti v najbežnejších typoch výpočtov akými sú výpočet vlastností atómov a molekúl, optimalizácia geometrie, spektroskopia, relativistické korekcie a pod. Naviac, účastníci kurzu môžu prísť s vlastným problémom súvisiacim s balíkom ORCA, ktorého riešeniu sa počas druhého dňa kurzu budú lektori venovať.

Workshop sa uskutoční v Bratislave, vo formáte F2F. Podujatie sa bude konať v angličtine. Vítaní sú účastníci z celej siete EuroCC!

Zúčastniť sa môžu iba účastníci z akademických inštitúcií.

Sledujte profily NCC na sociálnych sieťach a nenechajte si ujsť najnovšie správy o našich vzdelávacích podujatiach:

ABOUT ORCA

ORCA je viacúčelový softvérový kvantovo-chemický balík, ktorý sa disponuje širokou škálou metód, od semiempirických metód, teórie funkcionálu hustoty až po metódy založené na korelovanej,signle- a multiferenčnej vlnovej funkcii. ORCA umožňuje zohladniť vplyv prostredia, ako aj relativistické efekty. ORCA ponúka popredné softvérové nástroje na výpočet molekulových vlastností a ponúka natívny modul molekulovej dynamiky, ako aj natívny modul QM/MM pre rozsiahle systémy. ORCA je výkonný a všestranný softvérový balík pre kvantovú chémiu, primárne vyvinutý skupinou prof. Franka Neeseho. Je zadarmo pre akademické použitie, licencie (vrátane komerčných) sú dostupné prostredníctvom FACCT.

PROGRAM

Day 1: Introduction to ORCA and Basic Usage

Session 1: Introduction to ORCA

9:00 AM – 9:30 AM Registration and Welcome

9:30 AM – 10:00 AM Overview of High-Performance Computing (HPC) in Computational Chemistry

10:00 AM – 10:45 AM Introduction to the ORCA Package: Features and Capabilities

10:45 AM – 11:00 AM Break

Session 2: Installation and Setup

11:00 AM – 11:30 AM HPC cluster setup 

11:30 AM – 12:00 AM Installing ORCA on HPC Systems: Best Practices and Considerations

12:00 AM – 12:30 PM SLURM scheduler and first computation in ORCA

12:30 PM – 1:30 PM Lunch Break

Session 3: Basic Computations with ORCA

1:30 PM – 2:15 PM Input File Structure and Syntax: Getting Started with ORCA

2:15 PM – 3:00 PM Running Basic Quantum Chemistry Calculations

3:00 PM – 3:15 PM Break

Session 4: Analyzing ORCA Oputput

3:15 PM – 4:00 PM Analyzing ORCA Output: Extracting Useful Information and Plotting Results

4:00 PM – 4:30 PM Q&A and Wrap-Up of Day 1

Day 2: Advanced Computations and Scalability

Session 1: Advanced Computations with ORCA

9:00 AM – 10:30 AM Advanced Input Options:

10:30 AM – 10:45 AM Break

Session 2: Scalability of Computations

10:45 AM – 11:30 AM Understanding Scalability Metrics: Weak and Strong Scaling. Strategies for Improving Performance and Efficiency on HPC Systems

11:45 AM – 12:30 PM Evaluating Scalability of ORCA Computations – Practical Exercise

12:30 PM – 1:30 PM Lunch Break

Session 3: Case studies 

1:15 PM – 2:00 PM Calculations of redox potentials

2:00 PM – 2:45 PM Case studies prepared according to participants’ submissions 

2:45 PM – 3:00 PM Break

Session 4: Troubleshooting and best practices

3:00 PM – 4:00 PM Computational troubleshooting and best practices

4:00 PM – 4:30 PM Q&A and Wrap-Up of training

REGISTRÁCIA

Po registrácii dostanete e-mail s potvrdením registrácie. (Ak ste nedostali potvrdzujúci e-mail, skontrolujte si priečinok so spamom.)

PRAKTICKÉ INFORMÁCIE

Podujatie sa uskutoční v priestoroch Ústavu materiálov a mechaniky strojov (Slovenská akadémia vied) v Bratislave.

Adresa: ÚMMS SAV, v. v. i. Dúbravská cesta 9/6319 845 13 Bratislava
DD: 48.170532, 17.068432
DMS: N 48° 10′ 13.916”, E 17° 4′ 6.355”
Google Maps

Workshop je pre registrovaných účastníkov bezplatný. Účastníci budú mať zabezpečené občerstvenie a coffee breaks.

Aby ste sa mohli zúčastniť praktických cvičení, budete potrebovať vlastný notebook. Počas workshopu budete pracovať na HPC systéme Devana. Prístupové informácie a pokyny budú poskytnuté krátko pred workshopom.

Ako sa dostať do Bratislavy

Letecky: Bratislava Airport (BTS)

Priame lety lietajú do mnohých destinácií v Európe a priame lety do Bratislavy prevádzkuje množstvo leteckých spoločností. Bratislavské letisko je dostupné z centra mesta za 15–20 minút. Do centra mesta sa dostanete taxíkom – nezabudnite sa vopred opýtať na cenu alebo použite mobilnú aplikáciu HOPIN. Ak cestujete s obmedzeným rozpočtom, nastúpte na autobus č. 61 na hlavnú vlakovú stanicu. Do centra mesta sa odtiaľto dostanete pešo za 15 minút alebo autobusom č. 93 (zástavka Hodžovo námestie) alebo električkou č. 1 (zástavka Námestie SNP). Autobusové lístky sú k dispozícii v automatoch na autobusové zastávky alebo v kioskoch. Lístky stoja okolo 1 EUR a musia byť označene v automatoch v autobusoch.

Letecky: Vienna – Schwechat Airport (VIE)

Letisko Viedeň-Schwechat je len 40 kilometrov západne od Bratislavy a je jednou z hlavných brán na Slovensko. Autobusy do Bratislavy odchádzajú v 30 až 60-minútových intervaloch. Lístky sa dajú kúpiť v autobuse aj online prostredníctvom nasledujúcich spoločnosti slovaklines.sk, regiojet.com, flixbus.com.

Vlakom: ZSSK – Slovenský národný dopravca

Bratislava je prepojená s hlavnými linkami z Prahy, Budapešti, Viedne a rôznych regiónov Slovenska. Bratislavská hlavná stanica má dobré spojenie so zvyškom mesta električkami, autobusmi alebo trolejbusmi a do Starého Mesta sa dostanete pešo len za 15 minút. Z vlakovej stanice v Petržalke do centra mesta sa dostanete autobusmi č. 80, 91, 93.

Vlakom: RegioJet

Dopravca RegioJet zabezpečuje spojenie do Prahy, Brna a Pardubíc.

Autobusom

Bratislava je tiež spojená s mnohými európskymi mestami prostredníctvom siete autobusových liniek. Má časté spoje do okolia, ako aj do iných regiónov Slovenska. Hlavná autobusová stanice je Mlynské Nivy. Autobusy medzi Bratislavou a Viedňou premávajú v hodinových intervaloch.

Užitočné odkazy:

Slovaklines

regiojet.com

flixbus.com

Autom

Bratislava sa nachádza na križovatke niekoľkých dôležitých diaľnic. Vzdialenosť do Prahy je 330 km, Budapešti 200 km a Viedne 65 km. Ak prichádzate vlastným autom, musíte mať platnú elektronickú diaľničnú známku, aby ste mohli používať určené úseky diaľnic a rýchlostné cesty. Vineta sa vzťahuje na konkrétne časové obdobie bez ohľadu na prejdenú vzdialenosť alebo počet ciest. The minimálna doba platnosti je desať dní (stoja okolo 10 EUR). Ďalšie informácie získate kliknutím TU.

Zdroj – visitbratislava.com, kde nájdete množstvo užitočných tipov na cestovanie po Bratislave.

Kde sa ubytovať v Bratislave

Rôzne hotely, hostely, penzióny a ubytovanie v súkromí je možné rezervovať prostredníctvom štandardných poskytovateľov napr. Trivago alebo booking.com.

V blízkosti fakulty sa nachádza zopár hotelov:
Hotel Sorea Regia
Ako sa dostať z hotela na fakultu? => Električka č. 9 zo zastávky Kráľovské údolie na zastávku Botanická záhrada + 13 minút pešo.

Hotel Devin
Ako sa dostať z hotela na fakultu? => Električka č. 4 zo zastávky Most SNP na zastávku Riviera + 13 minút pešo.

Grand Hotel River Park
Ako sa dostať z hotela na fakultu? => Električka č. 4 zo zastávky Chatam Sófer na zastávku Botanická záhrada + 12 minút pešo.

Hotel Družba
Hotel Družba je cenovo dostupné ubytovanie pre študentov. Hotel sa nachádza 1,1 km od fakulty (14 min. pešo).

Training materials

ORCA tutorials – Compatible with ORCA 5.0! — ORCA tutorials 5.0 documentation (orcasoftware.de)