NCC pre HPC na CHEMSHOW
Dňa 27. júna 2023 v priestoroch Fakulty chemickej a potravinárskej technológie (FCHPT) Slovenskej technickej univerzity (STU) sa uskutočnilo podujatie s názvom „CHEMSHOW“. Počas podujatia návštevníci mali možnosť spoznať aj Národné kompetenčné centrum pre HPC a dozvedieť sa viac o jeho aktivitách. Odborníci predstavili služby NCC pre HPC. Prostredníctvom interaktívnej ukážky simulácií potenciálnych liečiv proti ochoreniu Covid-19 účastníkom priblížili, na aké výpočty sa môžu superpočítače využívať.
Na chemshow sme prezentovali výsledky výpočtov interakcie potenciálnych liečiv s aktívnou časťou jednotky spike-proteínu, ktorý tvorí tetraméry prítomné na povrchu vírusu SARS-CoV2, ktorý spôsobuje ochorenie COVID19. Výpočty boli realizované metódami molekulárnej mechaniky pomocou software-u GROMACS. V rámci štúdie bolo testovaných šesť potenciálnych liečiv. Na tejto prezentácii sme ukazovali najmä trajektóriu jednej z nich. Študenti stredných škôl mali možnosť pozrieť si výsledky na projekcii s 3D okuliarmi kde si mohli interaktívne meniť pohľad ako aj nastavenia zobrazovania proteínu.