NCC pre HPC na CHEMSHOW
Dňa 27. júna 2023 v priestoroch Fakulty chemickej a potravinárskej technológie (FCHPT) Slovenskej technickej univerzity (STU) sa uskutočnilo podujatie s názvom „CHEMSHOW“. Počas podujatia návštevníci mali možnosť spoznať aj Národné kompetenčné centrum pre HPC a dozvedieť sa viac o jeho aktivitách. Odborníci predstavili služby NCC pre HPC. Prostredníctvom interaktívnej ukážky simulácií potenciálnych liečiv proti ochoreniu Covid-19 účastníkom priblížili, na aké výpočty sa môžu superpočítače využívať.
Na chemshow sme prezentovali výsledky výpočtov interakcie potenciálnych liečiv s aktívnou časťou jednotky spike-proteínu, ktorý tvorí tetraméry prítomné na povrchu vírusu SARS-CoV2, ktorý spôsobuje ochorenie COVID19. Výpočty boli realizované metódami molekulárnej mechaniky pomocou software-u GROMACS. V rámci štúdie bolo testovaných šesť potenciálnych liečiv. Na tejto prezentácii sme ukazovali najmä trajektóriu jednej z nich. Študenti stredných škôl mali možnosť pozrieť si výsledky na projekcii s 3D okuliarmi kde si mohli interaktívne meniť pohľad ako aj nastavenia zobrazovania proteínu.
MATLAB v kocke: Možnosti systému MATLAB v príkladoch a aplikáciách 11 sep - Pozývame Vás na webinár „MATLAB v kocke“, ktorý priblíži prostredie MATLAB a jeho široké možnosti využitia. MATLAB je výkonný inžiniersky nástroj a interaktívne prostredie určené na vedecké a technické výpočty, analýzu a spracovanie dát, vizualizáciu a tvorbu algoritmov. V priebehu seminára sa účastníci oboznámia so základným rozhraním MATLABu, spôsobom jeho fungovania a praktickým využitím pri riešení rôznych úloh. Predstavená bude aj nadstavba Simulink, ktorá umožňuje modelovanie a simuláciu dynamických systémov alebo modelovanie algoritmov.
Ako komunikovať vedu a technológie efektívne: skúsenosti nášho tímu 22 aug - Náš tím sa dlhodobo venuje nielen rozvoju vysokovýkonného počítania, ale aj efektívnej komunikácii výsledkov a možností, ktoré prinášame priemyslu, akademickej sfére a mladej generácii výskumníkov. Považujeme to za kľúčovú súčasť našej práce – moderná vedecká a technologická inštitúcia dnes nemôže fungovať izolovane, ale musí vedieť jasne a zrozumiteľne komunikovať hodnotu a prínos svojich aktivít.
HPC a MATLAB: Silné partnerstvo pre dostupné superpočítače 19 aug - Minulý týždeň sa uskutočnilo zaujímavé pracovné stretnutie, na ktorom sa Lucia Malíčková, zastrešujúca Národné superpočítačové centrum a Národné kompetenčné centrum pre HPC, stretla s Martinom Foltínom zo spoločnosti HUMUSOFT s.r.o., oficiálneho distribútora MathWorks.