Spolupráca NCC a CoE: BioExcel workshop on GROMACS and HADDOCK
V dňoch 18. a 19. októbra 2023 sa v Bratislave konal workshop zameraný na prácu so softvérovými nástrojmi GROMACS a HADDOCK. Workshop bol výsledkom spolupráce kompetenčných centier na Slovensku, v Rakúsku, Českej republike a Maďarsku s centrom excelentnosti BioExcel. Tím BioExcel CoE vyvíja obe aplikácie a tak mohli skúsení lektori nielen ukázať bežné simulácie a modelovanie, ale aj odpovedať na špecifické otázky účastníkov.
Workshop sa konal v hybridnom formáte. Keďže hostiteľskou organizáciou bolo NCC Slovensko (s podporou rakúskeho NCC), pre hands-on cvičenia sa využíval nový slovenský superpočítač Devana. Okrem teoretickej prednášky si počas prvého dňa účastníci vyskúšali simuláciu molekulovej dynamiky pre jednoduchý membránový proteín pomocou GROMACS vrátane nastavenia vstupných súborov, ako aj samotnej simulácie pre minimalizáciu energie a produkciu dát. Cvičenie bolo realizované pomocou interaktívneho Jupyter notebooku. Zaujímavou súčasťou boli výpočty s využitím a porovnaním výkonu aplikácie na CPU a GPU výpočtových serveroch.
Druhý deň workshopu bol venovaný nástroju HADDOCK, ktorý sa používa na integratívne modelovanie rôznych typov biomolekulových systémov a ich interakcií. V súčasnosti je dostupná verzia HADDOCK3, ktorá ponúka okrem „data-driven docking“ aj modulárne nastavenie pracovného toku. Používateľ si môže pre svoj špecifický prípad vybrať vlastnú kombináciu nezávislých modulov.
Linky k materiálom nájdete na stránke workshopu TU. Ďakujeme všetkým partnerom a veríme, že prednášky a cvičenia boli pre účastníkov prínosné a že podobné podujatia vďaka spolupráci s komunitou EuroCC a centier excelentnosti ponúkneme aj v budúcnosti.
Prednáška o HPC, AI a kariérnych príležitostiach 15 mar - Na Obchodnej fakulte Ekonomickej univerzity v Bratislave (EUBA) sa 10. marca 2026 uskutočnila prednáška z praxe venovaná aktuálnym trendom v oblasti vysokovýkonného počítania (HPC), umelej inteligencie (AI) a kariérnym príležitostiam v digitálnom prostredí.
AI a superpočítače v praxi: prednáška pre študentov TUKE 13 mar - Dňa 5. marca 2026 sa na Technickej univerzite v Košiciach (TUKE) uskutočnila odborná prednáška Dr. Lucie Malíčkovej z Národného superpočítačového centra (NSCC) s názvom „Môžu byť superpočítač a umelá inteligencia užitoční?“. Podujatie sa konalo v posluchárni PK7 v hybridnom formáte (online aj prezenčne) a zúčastnilo sa ho 110 študentov TUKE.
Zodpovednosť už v návrhu: Od štandardov pre AI k praxi a certifikácii 12 mar - Ako Akt EÚ o AI premieňa harmonizované normy na reálne testovanie a certifikáciu umelej inteligencie. Zistite, ako sa Akt EÚ o AI posúva od regulačného textu k technickej implementácii — a čo to znamená pre organizácie, ktoré vyvíjajú a nasadzujú systémy AI.