Summer of HPC: Využitie neurónových sietí v kvantovej chémii
Získajte prostredníctvom letnej online stáže nové skúsenosti s programovaním neurónových sietí a ich využitím na predpovedanie vlastností molekúl. Využite leto 2021 naplno a staňte sa na dva mesiace virtuálne súčasťou nášho tímu v Bratislave. Prihláste sa na prestížnu letnú stáž v rámci programu Summer of HPC, ktorá je organizovaná Partnerstvom pre pokročilé počítanie v Európe (PRACE). PRACE sa snaží o nábor študentov-nadšencov HPC, ktorí majú záujem o letné stáže v niektorom z európskych HPC centier.
Cieľom tohto projektu je aplikácia neurónových sietí na predikciu molekulových vlastností (energie, náboje na atómoch alebo prítomnosť vodíkovej väzby) na základe štrukturálnych charakteristík jednotlivých molekúl. Na implementáciu tohto prístupu použijeme TensorFlow knižnicu v kombinácii s programovacím jazykom Python. Na vygenerovanie deskriptorov chemických systémov využijeme knižnicu DScribe. Výsledný program bude otestovaný na CPU aj GPU platformách – tým sa pokúsime potvrdiť vyššiu efektivitu platformy založenej na GPU pre aplikácie využívajúce neurónové siete. Študenti sa naučia veľa o neurónových sieťach, molekulových deskriptoroch, TensorFlow, GPU, MPI a tiež o HPC všeobecne.
Prihlásiť sa môžu aj študenti posledných ročníkov bakalárskeho štúdia a študenti magisterského štúdia. Na účasť na tomto projekte potrebujete ovládať základy programovacieho jazyka Python a základné znalosti z chémie a fyziky. Vzhľadom na to, že bude organizované školenie k HPC, predchádzajúce skúsenosti v tejto oblasti sa nevyžadujú. Najdôležitejším kritériom pre potenciálnych uchádzačov je chuť vzdelávať sa v oblasti HPC.
Študenti búdu mať prístup k potrebným učebným materiálom, ako aj k miestnemu superpočítaču IBM P775 a výpočtovým x86 klastrom s infinibandom.
Letný program sa začína 1. júla a končí 30. augusta. Na konci stáže študenti predstavia svoje projekty a môžu získať cenu za najlepší projekt!
Prihlásiť sa môžete do 12. apríla 2021.
Letná škola: Od supramolekulárnej chémie k štrukturálnej biológii metódami multiškálového modelovania 12 máj - Počítačové simulácie sa stali cenným nástrojom na rozšírenie našich vedomostí v mnohých oblastiach. Neustále sa zvyšujúci výkon superpočítačov alebo dokonca stolných počítačov nám umožňuje simulovať väčšie systémy alebo dosiahnuť vyššiu presnosť pomocou rutinných simulácií. Správne predpovede však možno získať len vtedy, ak sa použijú správne modely a teoretické prístupy. 
Národné kompetenčné centrum pre HPC na Dni Európy 12 máj - Dňa 9. mája v bratislavskej Starej tržnici prebiehala „oslava narodenín“ Európskej únie. Podujatie Deň Európy organizovala Kancelária Európskeho parlamentu a Zastúpenie Európskej komisie. Na Dni Európy predstavil svoje aktivity aj tím Národného kompetenčného centra pre vysokovýkonné počítanie. Dňom Európy si pripomíname Schumanovu deklaráciu, ktorá odštartovala modernú európsku integráciu a viedla k vytvoreniu súčasnej Európskej únie ako unikátneho mierového a demokratického projektu.
Registrácia otvorená: Code Tuning for the Exascale 4 máj - V dňoch 5. – 7. júna 2023 organizujeme v spolupráci s TREX Centrom Excelentnsoti a Národnými kompetenčnými centrami pre HPC z Rakúska a Českej republiky hands-on workshop zameraný na vývoj HPC aplikácií. Účastníci si budú môcť vyskúšať prácu s nástrojmi pre analýzu výkonnosti a identifikáciu bottleneck miest, ako je MAQAO. (www.maqao.org). Súčasťou workshopu budú praktické cvičenia, bude možné pracovať s vlastným softvérom, analyzovať ho a konzultovať s odbornými lektormi.
