Kategórie
Všeobecné

Summer of HPC: Efektívna konštrukcia Fockovej matice v lokalizovanej Hartree-Fockovej metóde

Summer of HPC: Efektívna konštrukcia Fockovej matice v lokalizovanej Hartree-Fockovej metóde. Získajte prostredníctvom letnej online stáže skúsenosti s programovaním a implementáciou paralelného programovania. Využite leto 2021 naplno a staňte sa na dva mesiace súčasťou nášho tímu v Bratislave. Počas stáže sa dozviete viac o Fortrane a MPI. Osvojíte si efektívne využitie tenzorových kontrakcií a paralelných I/O algoritmov v kvantovej chémií. Cieľom taktiež bude zvýšiť efektivitu MPI kódu(ov) na maximum.

Summer of HPC: Efektívna konštrukcia Fockovej matice v lokalizovanej Hartree-Fockovej metóde

Získajte prostredníctvom letnej online stáže skúsenosti s programovaním a implementáciou paralelného programovania.  Využite leto 2021 naplno a staňte sa na dva mesiace súčasťou nášho tímu v Bratislave. Počas stáže sa dozviete viac o Fortrane a MPI. Osvojíte si efektívne využitie tenzorových kontrakcií a paralelných I/O algoritmov v kvantovej chémií. Cieľom taktiež bude zvýšiť efektivitu MPI kódu(ov) na maximum.

PRACE – Partnerstvo pre pokročilé počítanie v Európe, organizuje prestížne letné stáže v rámci programu Summer of HPC, ktoré sú určené pre absolventov a postgraduálnych študentov. PRACE sa snaží o nábor študentov-nadšencov HPC, ktorí majú záujem o letné stáže v niektorom z európskych HPC centier, kde si môžu zlepšiť svoje zručnosti v rôznych oblastiach.

Riešenie modelu nezávislých častíc (DFT alebo Hartree-Fockova metóda) je jedným z kľúčových cieľov mnohých programov využívaných v kvantovej chémii. Hartree-Fockova metóda je iteračná metoda, ktorá pozostáva z dvoch časovo náročných krokov. Prvým je konštrukcia Fockovej matice z integrálov a matice hustoty. Druhým je diagonalizácia vytvorenej Fockovej matice.

Pred niekoľkými rokmi sme nahradili diagonalizačný krok násobením matíc. Nedávno sme implementovali riešenia Hartree-Fock rovníc v lokalizovaných orbitáloch, čo otvára cestu k programu použiteľnom aj pre veľmi veľké molekuly. Na začiatku procesu sú integrály transformované do lokalizovanej bázy molekulárnych orbitálov a sú používané počas celého behu programu. Matica integrálov by mala byť riedkou spôsobom jej konštrukcie. Matica hustoty je aktualizovaná v každom kroku iteratívnej procedúry a pre veľké systémy je tiež riedkou. Momentálne je konštrukcia Fockovej matice implementovaná len v sekvenčnom móde.

Študenti budú spolupracovať na implementácií a testovaní výkonu konštrukcie Fockovej matice, pričom búdu implementované a otestovane dva rôzne prístupy. Prvým je BLAS v kombinácií s OpenMP alebo MPI. Druhým je implementácia konštrukcie Fockovej matice pomocou násobenia riedkej matice. Oba algoritmy búdu implementované v lokálnej verzii programu kvantovej chémie DIRCCR12OS, ktorý je väčšinou programovaný v jazyku Fortran. Program obsahuje fungujúce prostredie MPI, takže študenti búdu používať niekoľko rutín, ktoré už sú implementované v kóde.

Prihlásiť sa môžu aj študenti posledných ročníkov bakalárskeho štúdia a študenti magisterského štúdia. Potrebné sú znalosti z kvantovej chémie alebo fyziky. Pokročilé znalosti Fortranu, základné znalosti MPI, knižníc BLAS a ďalších nástrojov HPC sú vítané. Vzhľadom na to, že bude organizované školenie k HPC, predchádzajúce skúsenosti v tejto oblasti sa nevyžadujú. Najdôležitejším kritériom pre potenciálnych uchádzačov je chuť vzdelávať sa v oblasti HPC.

Študenti búdu mať prístup k potrebným učebným materiálom, ako aj k miestnemu superpočítaču IBM P775 a výpočtovým x86 klastrom s infinibandom.

Letný program sa začína 1. júla a končí 30. augusta. Na konci stáže študenti predstavia svoje projekty a môžu získať cenu za najlepší projekt!

Prihlásiť sa môžete do 12. apríla 2021.

Podať žiadosť

Vzdelávacie materiály

Viac informácií o projekte

Budovanie medzinárodnej spolupráce v oblasti HPC: Návšteva v ITER Tenerife a Teide HPC 17 júl - Začiatkom júla 2025 mala zástupkyňa Národného superpočítačového centra (NSCC) a Národného kompetenčného centra pre vysokovýkonné počítanie (NCC pre HPC) Lucia Malíčková príležitosť navštíviť významné technologické a výskumné centrum ITER – Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, S.A. na ostrove Tenerife. V rámci pracovnej návštevy sa stretla s riaditeľom centra Carlosom Suarezom a Jesúsom Rodríguezom Alamo, aby diskutovali o možnostiach nadviazania spolupráce v oblasti vysokovýkonného počítania (HPC), výskumu, vývoja a inovácií s využitím moderných technologických infraštruktúr.
Stretnutie s Michalom Valkom, expertom na veľké jazykové modely 15 júl - Národné superpočítačové centrum a Národné komeptenčé centrum pre HPC, ktoré zastupovala Lucia Malíčková, sa stretlo s významným slovenským vedcom Michalom Valkom, ktorý patrí medzi špičku v oblasti umelej inteligencie a strojového učenia vo svete. Diskutovali spolu o možnostiach budúcej spolupráce, pričom hlavnou témou bolo využitie slovenských HPC kapacít na podporu pokročilého výskumu v oblasti veľkých jazykových modelov a algoritmov učenia s minimálnou spätnou väzbou.
Dáta, teológia a HPC: Spolupráca, ktorá hľadá cesty k porozumeniu 8 júl - Pokračujeme v spolupráci s Teologickou fakultou Trnavskej univerzity! Národné superpočítačové centrum (NSCC) a Národné kompetenčné centrum pre HPC pokračuje aj v roku 2025 v spolupráci s Teologickou fakultou Trnavskej univerzity. Po úspešnej spoločnej štúdii, ktorá ukázala potenciál umelej inteligencie a výsokovykonného počítania pri analýze náboženských textov, sa zástupcovia oboch inštitúcií opäť stretli, aby identifikovali nové prieniky pre budúce projekty.